男女主角的技能区别主要体现在攻击类型和技能效果上，但实际战斗中的差异并不显著。男主角默认采用物理攻击，女主角则为法术攻击，这种基础设定决定了他们在队伍中的定位倾向。游戏并未通过技能机制刻意强化性别差异，两者的技能形态和功能更多依赖于时装、化身等养成系统的搭配。从实际体验来看，选择男女主角对阵容构建的影响有限，玩家无需因技能差异过度纠结初始性别选择。
男女主角的技能效果差异主要来源于时装和化身系统的附加属性。红时装或金化身会显著改变主角的主动与被动技能效果，例如提升暴击率、格挡率或增加控制类技能触发概率。无论选择男性还是女性主角，这些养成内容均能通过相同途径获取，且加成幅度基本持平。部分高阶时装会赋予主角阵营专属的增益效果，但这类设计并不与性别直接绑定，而是与玩家选择的阵营相关。
在实战表现上，男女主角的核心差异仅体现在攻击类型对敌方防御属性的计算方式上。物理攻击受敌方护甲影响，法术攻击则与抗性相关，但游戏中后期装备、神兵等系统提供的属性加成足以弥补这种基础差异。主角的坦度和输出能力更多取决于星级提升带来的闪避、抗暴等通用属性，而非性别决定的初始模板。主角作为必须上阵的单位，其技能组设计更偏向均衡性，不会因性别导致明显的强度失衡。
从养成策略角度分析，男女主角的培养优先级和资源投入方向几乎一致。三星阶段解锁的格挡率加成、后续开放的闪避与抗暴率提升等关键节点，对两者同样重要。玩家更需关注的是如何通过神兵搭配强化主角特性，例如雌雄双股剑提升暴击率适用于物理系主角，而火云剑的灼烧效果对法术系主角有额外增益。这种装备适配性仅与技能效果类型相关，与性别无必然联系。
少年三国志2刻意淡化了男女主角的技能差异，两者在战斗中的实际差距远小于阵营选择和养成深度带来的影响。这种设计使得性别选择更倾向于外观偏好而非强度考量，玩家可根据个人审美自由决定初始角色，无需担心因性别导致阵容强度受限。游戏通过均衡的技能机制和共享的养成体系，确保了不同选择路径下的公平性。
