构建一支高效通关的队伍需要综合考虑属性克制、技能搭配与战术平衡。一周目推荐以初始精灵为核心，搭配高种族值的准神兽或功能性宝可梦。例如选择大力鳄作为水系主力，其物理攻击成长优秀，44级可习得龙舞强化，配合攀瀑与冰牙能覆盖多数对手；暴鲤龙同样是优质选择，固执性格搭配龙舞与地震可快速清场。飞行系推荐叉字蝠，高速高攻特性适合先手压制，而耿鬼凭借幽灵系抗性与特攻输出能有效针对超能系道馆。
二周目阵容需针对传说宝可梦和冠军战调整。凤王或洛奇亚作为封面神兽必带，前者火+飞行属性克制虫草钢，后者高耐久适合消耗战。快龙凭借龙舞与多重鳞片特性成为物理核心，搭配神速补刀效果显著。队伍中还需配置电系或岩石系成员应对水系与飞行系威胁，如三合一磁怪或隆隆岩。注意避免属性重复，例如同时携带暴鲤龙与乘龙会导致电系弱点过于集中。
主力输出手需配备本系高威力技能，如暴鲤龙的攀瀑、快龙的逆鳞。辅助型成员建议携带变化技能，光伊布可学习反射壁与晨光提升团队生存，胡地的特性交换能干扰对手战术。碎岩、冲浪等秘传技建议由工具宠学习，避免占用主力技能栏。亲密度进化的宝可梦如风妖精需提前培养，其速度与干扰能力在后期至关重要。
连接洞穴最深处的乘龙（周五出现）可补充冰水双系打击面；狩猎区域的赫拉克罗斯虫+格斗属性能克制恶岩冰。隐藏剧情中的红蓝水都（拉帝亚斯/拉帝欧斯）需通过事件触发，其高特攻与龙系抗性适合特攻队。注意部分宝可梦如波克基斯需要光之石进化，需提前规划道具获取。
飞行系道馆优先用电系或岩石系压制，超能系道馆依赖恶系或幽灵系速攻。四天王战前建议将全员等级提升至55携带足够复活药与全复药。冠军渡的快龙与暴鲤龙需用冰系与电系针对性打击，队伍中至少保留一名高速控场手应对残局。
最终成型的理想阵容应包含2-3名主攻手、1名盾牌、1名干扰手及1名属性补位成员。例如：大力鳄（龙舞/攀瀑/冰牙/地震）+ 耿鬼（影子球/十万伏特/同命/催眠术）+ 大钢蛇（地震/岩崩/隐形岩/吼叫）+ 暴鲤龙（龙舞/攀瀑/弹跳/咬碎）+ 快龙（神速/逆鳞/火焰拳/羽栖）+ 乘龙（冲浪/冰冻光束/精神干扰/唱歌）。此组合覆盖18种属性打击面，弱点仅集中在电系与格斗系，可通过轮换化解。
